生物信息学Linux最简入门

目录操作
- pwd, cd, ls, mkdir
文件操作
- mv
- cp
- rm
- ln
- split
文本浏览
- head, tail：Linux 命令：查看文件开头与末尾 head 与 tail
- less，more
- tac, rev ： Linux命令：逆序输出 tac 与 rev
文本查找
- grep
文本操作
- cat & paste：Linux命令：纵向/横向合并文本 cat/paste
- join：Linux命令：连接表格 join
- uniq：Linux命令：去除重复的行 uniq
- sort：Linux命令：排序 sort
- tr：Linux命令：替换与删除 tr
- cut： Linux命令：提取列 cut
- diff
- expand & unexpand
高级文本操作
- awk常用操作
- sed常用操作
Linux ：输入/输出重定向 >, 1>, 2>, &>, >> , <<
括号
- ()
- {}
扩展与替换
- {}括号扩展
- 命令替换
- 进程替代： Linux: 进程替代 >(command) <(command)
- 参数扩展：参数扩展 Parameter Expansion
- 数学扩展
文件归档，压缩与解压缩
- 文件归档, 压缩与解压缩 – tar/gzip/bgzip/gzip2/zip/zstd
- 压缩文件的快速查看 – zcat / zmore /zless /zgrep /zdiff
文件内容验证
- md5sum
- sha1sum
pdf格式转图片
- pdftoppm
文件/路径/命令查找
- which, find, locate
- man, whiatis, apropos, whereis
网络 / 下载
- wget/ curl
- ping
- ip
- ifconfig
运行维护与管理
- du / df
- ps
- kill
- whoami / groups / uname / hostname /id
- top, free
- jobs, nohup , disown
权限管理
- chmod chown chgrp
Shell脚本
- if / test
- for / while
变量管理环境配置
- export

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